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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
05/03/2015 |
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Data da última atualização: |
02/07/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
HELENE, L. C. F.; DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; HUNGRIA, M. |
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Afiliação: |
UEL; UEL; UEL; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO. |
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Título: |
Estudo filogenético da diversidade do gênero Bradyrhizobium por MLSA e utilização desta técnica para designar possíveis novas espécies. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: ENCONTRO NACIONAL DE MICROBIOLOGIA AMBIENTAL, 14., 2014, João Pessoa. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Resumo 86-1. |
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Conteúdo: |
Bactérias simbióticas fixadoras de nitrogênio, também chamadas popularmente de rizóbios, têm grande relevância agronômica, pois fornecem quantidades significativas de N para as plantas e colaboram para a recuperação de solos e ambientes degradados. Nos últimos anos, com o avanço das técnicas moleculares e das análises genéticas, diversos trabalhos têm demonstrado que essas bactérias apresentam uma elevada diversidade genética, resultando em reclassificações taxonômicas e na descrição de novas espécies. Apesar do gene ribossomal 16S (16S RNAr) ainda ser utilizado em análises filogenéticas de procariotos, sua alta conservação não é capaz de revelar diferenças entre espécies de diversos gêneros, incluindo Bradyrhizobium. Outras metodologias, como o MLSA (Multilocus Sequence Analysis), estão sendo utilizadas para elucidar esses casos, com bons resultados. Neste trabalho, 15 estirpes de Bradyrhizobium sem posicionamento taxonômico claro foram utilizadas em estudos de filogenia e taxonomia com base na técnica de MLSA. Para isso, quatro genes housekeeping foram sequenciados, resultando em uma sequência concatenada, que foi utilizada para a construção de uma árvore filogenética, que foi comparada com a árvore do gene 16S RNAr. Das 15 estirpes, oito agruparam com a espécie B. pachyrhizi, enquanto as SEMIAS 6159 e 6480 ocuparam posições isoladas, e dois grupos (SEMIAS 6399 e 6404, e SEMIAS 690, 1153 e 1190) não apresentaram semelhança genética com nenhuma espécie descrita. Esses grupos merecem estudos mais detalhados, pois apresentam grande potencial de representarem espécies novas. As estirpes SEMIAS 690, 1153 e 1190 foram selecionadas para estudos visando a descrição de uma nova espécie, tendo início um estudo polifásico (análises genéticas, fenotípicas e filogenéticas). Dos resultados obtidos até o presente momento, o perfil de BOX-PCR agrupou as estirpes com mais de 73% de similaridade entre si, e inferiores a 66% com as espécies já descritas. Os testes fenotípicos (fontes de carbono, testes morfológicos, condições de crescimento) são congruentes entre as estirpes representantes das novas espécies e as demais análises necessárias para descrição de espécies procarióticas estão em andamento. Os resultados obtidos confirmam que a técnica de MLSA é eficiente para estudos filogenéticos de procariotos, mostrando ser uma forma segura e rápida de análise da diversidade dos gêneros e identificação de possíveis novas espécies. MenosBactérias simbióticas fixadoras de nitrogênio, também chamadas popularmente de rizóbios, têm grande relevância agronômica, pois fornecem quantidades significativas de N para as plantas e colaboram para a recuperação de solos e ambientes degradados. Nos últimos anos, com o avanço das técnicas moleculares e das análises genéticas, diversos trabalhos têm demonstrado que essas bactérias apresentam uma elevada diversidade genética, resultando em reclassificações taxonômicas e na descrição de novas espécies. Apesar do gene ribossomal 16S (16S RNAr) ainda ser utilizado em análises filogenéticas de procariotos, sua alta conservação não é capaz de revelar diferenças entre espécies de diversos gêneros, incluindo Bradyrhizobium. Outras metodologias, como o MLSA (Multilocus Sequence Analysis), estão sendo utilizadas para elucidar esses casos, com bons resultados. Neste trabalho, 15 estirpes de Bradyrhizobium sem posicionamento taxonômico claro foram utilizadas em estudos de filogenia e taxonomia com base na técnica de MLSA. Para isso, quatro genes housekeeping foram sequenciados, resultando em uma sequência concatenada, que foi utilizada para a construção de uma árvore filogenética, que foi comparada com a árvore do gene 16S RNAr. Das 15 estirpes, oito agruparam com a espécie B. pachyrhizi, enquanto as SEMIAS 6159 e 6480 ocuparam posições isoladas, e dois grupos (SEMIAS 6399 e 6404, e SEMIAS 690, 1153 e 1190) não apresentaram semelhança genética com nenhuma espécie descrita. Esses grupo... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Fixação de Nitrogênio. |
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Thesaurus Nal: |
Bradyrhizobium; Nitrogen fixation. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/119545/1/Estudo-filogenetico-da-diversidade-do-genero-Bradyrhizobium-por-MLSA-e-utilizacao-desta-tecnica-para-designar-possiveis-novas-especies..pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
10/01/2002 |
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Data da última atualização: |
22/08/2022 |
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Autoria: |
RORATO, P. R. N.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINEZ, M. L.; FERREIRA, G. B.; VALENTE, J. |
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Afiliação: |
CNPGL. |
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Título: |
Interação genótipo-ambiente para a produção de leite em rebanhos da raça holandesa no Brasil: I modelo de touro. |
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Ano de publicação: |
1999 |
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Fonte/Imprenta: |
Ciencia Rural, Santa Maria, v. 29, n. 4, p. 717-720, 1999. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1590/S0103-84781999000400024 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
RESUMO - Com o objetivo de avaliar o efeito da interação genótipo-ambiente sobre o desempenho produtivo de vacas da raça Holandesa no Brasil, foram estudados os registros de produção total de leite à primeira lactação de 14.418 vacas filhas de 324 touros e distribuídas em 181 rebanhos em diferentes estados, no período de 1981 a 1991. Os dados foram estratificados de acordo com a produção média de leite do rebanho, em nível baixo (B), médio (M) e alto (A). Os componentes de (co)variância foram estimados utilizando-se o método da máxima verossimilhança restrita e dois modelos de touro. Os componentes de variância de touro variaram de 116.879 a 274.871 e foram maiores nos níveis mais altos; os residuais variaram de 1.691.879 a 1.956.025, crescendo com o nível de produção dos rebanhos e os da interação variaram de 66.854 a 149.972, tendo o maior valor ocorrido nos níveis extremos de produção. Os coeficientes de herdabilidade variaram de 0,22 a 0,49 e os de correlação genética foram 0,22, 0,46 e 0,69, entre os níveis B e A, B e M e M e A, respectivamente. ABSTRACT - Records on 14.418 first lactations of Holstein cows sired by 324 bulls distributed in 181 herds in different States from 1981 to 1991, were used to study the effect of genotype-environment interaction on milk production. The data were distributed in three levels (low-B, medium-M, and high-A) according to the average of the herd milk production. (Co)variances components were estimated by REML using two sire models. The variance components of sire ranged from 116,879 to 274,871 were larger at the higher levels, the residuals ranged from 1,691,879 to 1,956,025, increasing with the production level of the herds and the interaction ranged from 66,854 to 149,972 with the highest value when the daughters performed at the extreme levels. The heritabilities ranged from 0.22 to 0.49 and the genetic correlations were 0.22, 0.46, and 0.69, respectivelly, among the levels low and high, low and medium, and medium and high. MenosRESUMO - Com o objetivo de avaliar o efeito da interação genótipo-ambiente sobre o desempenho produtivo de vacas da raça Holandesa no Brasil, foram estudados os registros de produção total de leite à primeira lactação de 14.418 vacas filhas de 324 touros e distribuídas em 181 rebanhos em diferentes estados, no período de 1981 a 1991. Os dados foram estratificados de acordo com a produção média de leite do rebanho, em nível baixo (B), médio (M) e alto (A). Os componentes de (co)variância foram estimados utilizando-se o método da máxima verossimilhança restrita e dois modelos de touro. Os componentes de variância de touro variaram de 116.879 a 274.871 e foram maiores nos níveis mais altos; os residuais variaram de 1.691.879 a 1.956.025, crescendo com o nível de produção dos rebanhos e os da interação variaram de 66.854 a 149.972, tendo o maior valor ocorrido nos níveis extremos de produção. Os coeficientes de herdabilidade variaram de 0,22 a 0,49 e os de correlação genética foram 0,22, 0,46 e 0,69, entre os níveis B e A, B e M e M e A, respectivamente. ABSTRACT - Records on 14.418 first lactations of Holstein cows sired by 324 bulls distributed in 181 herds in different States from 1981 to 1991, were used to study the effect of genotype-environment interaction on milk production. The data were distributed in three levels (low-B, medium-M, and high-A) according to the average of the herd milk production. (Co)variances components were estimated by REML using two sire models. The... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Genotype by environment interaction; Interacao genotipo-ambiente; Maxima verosimilhanca restrita; Producao de leite; Restricted maximum likelihood. |
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Thesaurus NAL: |
milk production. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/593763/1/Interacao-genotipo-ambiente-para-a-producao-de-leite-I-modelo-de-touro.pdf
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Marc: |
LEADER 02911naa a2200253 a 4500
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005 2022-08-22
008 1999 bl uuuu u00u1 u #d
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520 $aRESUMO - Com o objetivo de avaliar o efeito da interação genótipo-ambiente sobre o desempenho produtivo de vacas da raça Holandesa no Brasil, foram estudados os registros de produção total de leite à primeira lactação de 14.418 vacas filhas de 324 touros e distribuídas em 181 rebanhos em diferentes estados, no período de 1981 a 1991. Os dados foram estratificados de acordo com a produção média de leite do rebanho, em nível baixo (B), médio (M) e alto (A). Os componentes de (co)variância foram estimados utilizando-se o método da máxima verossimilhança restrita e dois modelos de touro. Os componentes de variância de touro variaram de 116.879 a 274.871 e foram maiores nos níveis mais altos; os residuais variaram de 1.691.879 a 1.956.025, crescendo com o nível de produção dos rebanhos e os da interação variaram de 66.854 a 149.972, tendo o maior valor ocorrido nos níveis extremos de produção. Os coeficientes de herdabilidade variaram de 0,22 a 0,49 e os de correlação genética foram 0,22, 0,46 e 0,69, entre os níveis B e A, B e M e M e A, respectivamente. ABSTRACT - Records on 14.418 first lactations of Holstein cows sired by 324 bulls distributed in 181 herds in different States from 1981 to 1991, were used to study the effect of genotype-environment interaction on milk production. The data were distributed in three levels (low-B, medium-M, and high-A) according to the average of the herd milk production. (Co)variances components were estimated by REML using two sire models. The variance components of sire ranged from 116,879 to 274,871 were larger at the higher levels, the residuals ranged from 1,691,879 to 1,956,025, increasing with the production level of the herds and the interaction ranged from 66,854 to 149,972 with the highest value when the daughters performed at the extreme levels. The heritabilities ranged from 0.22 to 0.49 and the genetic correlations were 0.22, 0.46, and 0.69, respectivelly, among the levels low and high, low and medium, and medium and high.
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653 $aInteracao genotipo-ambiente
653 $aMaxima verosimilhanca restrita
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773 $tCiencia Rural, Santa Maria$gv. 29, n. 4, p. 717-720, 1999.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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